Mitätöity sekki on peruutettu sekki. Kun sekkiä on mitätöity asianmukaisesti, sekkiä ei voi käyttää. Mitätöidylle sekille voi olla useita syitä, mukaan lukien seuraavat:
Tarkistusta täytettäessä tapahtui virhe
Sekki oli tyhjä tai täytetty vain osittain
Sekki annettiin virheellisesti
Työntekijä toimitti shekin työnantajalle käytettäväksi suoran talletuksen palkkatilin perustamiseen
Kaikissa näissä tapauksissa mitätöityä sekkiä ei makseta.
Mitätöity sekki voi olla rei'itetty "Tyhjä" -leimalla tai yliviivattu, tai "Tyhjä" on kirjoitettu sen yli, silputtu tai yksinkertaisesti se voidaan tallentaa mitätöityyn sekkitiedostoon. On parasta kumota tai tuhota mitätöity sekki pysyvästi, jotta kukaan ei voi esittää sitä pankille myöhemmin ja odottaa saavansa siitä maksua. Jos sekkiä ei tällä hetkellä ole yrityksen hallussa, ota sitten yhteyttä pankkiin ja valtuuta sekillä pysäytysmaksu (josta pankki perii maksun).
Kirjanpitojärjestelmässä sekki olisi kirjattu, kun se alun perin luotiin, joten on tehtävä peruutusmerkintä, että veloitetaan (lisätään) käteistä ja hyvitetään (vähennetään) tiliä, johon maksu kohdistuu. Jos maksu olisi siis suoritettu kustannuksella, hyvitys olisi siihen liittyvälle kulutilille; jos maksu olisi ollut omaisuuserän hankkiminen, hyvitys olisi siihen liittyvälle omaisuuserille.
Jos tarkistusrekisteriä on, peruutusmerkintä on tarpeen, jotta kirjataan sekkiin painettuun sekinumeroon liittyvän kirjanpitotapahtuman eliminointi.
Tietokoneavusteisessa kirjanpitojärjestelmässä on yleensä valikkovaihtoehto sekin mitätöimiseksi, koska tämä on riittävän yleinen toiminta, jotta voidaan perustaa oma rutiini.