Vaihtoehtoisia menettelyjä ovat ne lisäauditointitestit, joita käytetään, kun alkuperäisiä suunniteltuja auditointimenettelyjä ei voida suorittaa tai ne osoittautuvat tehottomiksi. Esimerkiksi tilintarkastaja lähettää saamisvahvistuksia asiakkaan asiakkaille, mutta vastauksia on niin vähän, että tilintarkastajan on käytettävä vaihtoehtoisia menettelyjä, kuten vertaamalla myöhempiä kassatuloja vuoden lopun saamisiin. Vastaavasti tilintarkastaja ei voi osallistua asiakkaan vuoden lopun varastonlaskentaan ja päättää käyttää vaihtoehtoista menettelyä, joka jäljittää lopputuotteiden myynnin vuoden lopun varastotietueisiin.
Kun vaihtoehtoiset menettelyt on suoritettu, tilintarkastajan on määritettävä, onko kerätty riittävästi ylimääräistä tilintarkastusnäyttöä. Jos ei, on suoritettava muita vaihtoehtoisia toimenpiteitä. Kun kaikki tarkastuskokeet on saatu päätökseen, tilintarkastajan tulee dokumentoida ne tarkastuksen työasiakirjoissa.