Yritysten välinen kirjanpito on joukko menettelyjä, joita emoyhtiö käyttää tytäryhtiöidensä välisten liiketoimien eliminoimiseksi. Esimerkiksi, jos yksi tytäryhtiö on myynyt tavaroita toiselle tytäryhtiölle, tämä ei ole pätevä myyntitapahtuma emoyhtiön näkökulmasta, koska liiketoimi tapahtui sisäisesti. Tästä johtuen myynti on poistettava kirjanpidosta siinä vaiheessa, kun emoyhtiön konsernitilinpäätös laaditaan, jotta se ei näy tilinpäätöksessä.
Yritysten väliset liiketapahtumat voidaan merkitä organisaation kirjanpitojärjestelmään alkupisteessä, jotta ne voidaan automaattisesti taata, kun konsernitilinpäätös laaditaan. Jos ohjelmistossa ei ole merkintäominaisuutta, tapahtumat on tunnistettava manuaalisesti, mikä aiheuttaa suurta virhettä. Jälkimmäinen tapaus on yleisin pienemmässä organisaatiossa, joka on käyttänyt vähemmän ominaisuuksiltaan monipuolista kirjanpitojärjestelmää, ja toteaa nyt, että sillä ei ole tarvittavia tapahtumien merkintäominaisuuksia tytäryhtiöidensä kirjanpitoon.
Yritysten välinen kirjanpito voi olla yksi tärkeimmistä pullonkauloista emoyhtiön kirjojen sulkemisprosessissa, joten johdon tulisi kiinnittää siihen huomiota etsimään tapoja virtaviivaistaa prosessia.
