Tarkastusohjelma on tarkistuslista tarkastusmenettelyistä, joita tilintarkastajan on noudatettava auditoinnin loppuun saattamiseksi. Tarkastaja allekirjoittaa jokaisen tarkistusluettelokohteen, kun se on valmis, ja lisää sitten tarkastusohjelman tarkastuksen työasiakirjoihin todisteena siitä, että tarkastusvaiheet on suoritettu. Tarkastusohjelman sisältö vaihtelee tarkastuksen laajuuden ja luonteen sekä toimialoittain. Saatavilla on useita vakiomaisia tarkastusoppaita, jotka on räätälöity yksittäisille toimialoille.